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《天津医科大学学报》[ISSN:1006-8147/CN:12-1259/R]

卷:

29卷

期数:

2023年03期

页码:

227-234

栏目:

生物信息学专题

出版日期:

2023-05-20

文章信息/Info

Title:

The mechanism of gingko leaf intervention in diabetic cardiomyopathy based on network pharmacology and molecular docking

文章编号:

1006－8147（2023）03-0227-08

作者:

孔一晗¹; 董亚¹; 常柏²

（1.天津医科大学研究生院，天津 300070；2.天津医科大学朱宪彝纪念医院，天津市内分泌研究所国家卫健委激素与发育重点实验室，天津市代谢性疾病重点实验室，天津 300134）

Author(s):

KONG Yi-han¹; DONG Ya¹; CHANG Bai²

（1.Graduate School，Tianjin Medical University，Tianjin 300070，China；2. Key Laboratory of Hormones and Development，Tianjin Key Laboratory of Metabolic Diseases，National Health Commission，Tianjin Institute of Endocrinology，Chu Hsien-I Memorial Hospital，Tianjin Medical University，Tianjin 300134，China）

关键词:

银杏叶; 糖尿病心肌病; 网络药理学

Keywords:

ginkgo leaf; diabetic cardiomyopathy; network pharmacology

分类号:

R541

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

目的：使用网络药理学的方法研究银杏叶治疗糖尿病心肌病的机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索银杏叶的主要成分，通过GeneCard、OMIM、Disgenet数据库筛选糖尿病心肌病的潜在靶点，利用韦恩图获取银杏叶与糖尿病心肌病的共同靶点，导入STRING蛋白互作平台建构PPI互作网络图，用Cytoscape软件将互作图进行拓扑学分析，并筛选出核心交集靶点。使用DAVID在线数据库对交集靶点进行GO与KEGG富集分析。最后对筛选得到的部分关键靶点及其对应化合物进行分子对接，进一步验证银杏叶干预糖尿病心肌病的核心作用靶点。结果：银杏叶与糖尿病心肌病共有91个交集靶点，通过拓扑学分析发现蛋白激酶B1（Akt1）、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、白细胞介素-1β（IL-1β）是银杏叶治疗糖尿病心肌病的核心靶点。KEGG通路富集分析结果显示，银杏叶作用于糖尿病心肌病的通路涉及糖尿病并发症中AGEs-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、IL-17信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等。结论：银杏叶可能通过作用于Akt1、TNF、IL-6、VEGFA、IL-1β等靶点减轻炎症和氧化应激水平，抑制心肌细胞凋亡。

Abstract:

Objective： To study the mechanism of ginkgo leaf in the treatment of diabetic cardiomyopathy by network pharmacology. Methods：The main components of ginkgo leaf were searched in the Traditional Chinese Medicine Pharmacology Database and Analysis Platform（TCMSP），and the potential targets of diabetic cardiomyopathy were screened by GeneCard，OMIM and Disgenet databases. The common targets of ginkgo leaf and diabetic cardiomyopathy were obtained by Venn diagram. The STRING protein interaction platform was imported to construct the PPI interaction network diagram. Topological analysis was carried out on the interaction diagram using Cytoscape software，and core intersection targets were screened. GO and KEGG enrichment analysis of intersection targets was performed using DAVID online database. Finally，molecular docking of some key targets and their corresponding compounds was performed to further verify the core target of ginkgo leaf in the intervention of diabetic cardiomyopathy. Results：There were 91 intersection targets between ginkgo leaf and diabetic cardiomyopathy. Topological analysis showed that protein kinase B1（Akt1），tumor necrosis factor（TNF），interleukin-6（IL-6），vascular endothelial growth factor A（VEGFA） and interleukin-1beta（IL-1β） were the core targets of ginkgo leaf in the treatment of diabetic cardiomyopathy. KEGG pathway enrichment analysis showed that the pathway of ginkgo leaf on diabetic cardiomyopathy involved AGEs-RAGE signaling pathway，lipid and atherosclerosis，IL-17 signaling pathway，TNF signaling pathway，HIF-1 signaling pathway and so on in diabetes complications. Conclusion：Ginkgo leaf may reduce inflammation and oxidative stress levels by acting on Akt1，TNF，IL-6，VEGFA，IL-1β and other targets，and inhibit myocardial apoptosis.

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备注/Memo

备注/Memo:

基金项目 国家自然科学基金面上项目（81973614）
作者简介 孔一晗（1998-），男，硕士在读，研究方向：中西医结合防治糖尿病及其并发症，通信作者：常柏，E-mail：changbai1972@126.com。

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更新日期/Last Update: 1900-01-01